Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNTN1Q12860 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNTN1Q12860 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNTN1Q12860 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CNTN1Q12860 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CNTN1Q12860 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CNTN1Q12860 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CNTN1Q12860 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CNTN1Q12860 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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