Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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