Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FMODQ06828 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FMODQ06828 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FMODQ06828 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FMODQ06828 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms