Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDR2Q01850 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms