Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms