Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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