Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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