Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3M2P53677 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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