Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms