Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT6CP48668 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms