Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms