Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms