Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA2P42262 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms