Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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