Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1P21675 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1P21675 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1P21675 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1P21675 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1P21675 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1P21675 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1P21675 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1P21675 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1P21675 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1P21675 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1P21675 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms