Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms