Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGAMP11215 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms