Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR5O60602 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR5O60602 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR5O60602 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLR5O60602 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLR5O60602 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms