Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms