Protein–RNA interactions for Protein: O00623

PEX12, Peroxisome assembly protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX12O00623 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX12O00623 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX12O00623 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX12O00623 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX12O00623 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms