Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms