Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms