Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms