Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms