Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms