Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms