Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms