Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF8Q9UPP1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms