Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms