Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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