Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms