Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms