Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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