Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL11Q9NVR0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms