Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms