Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms