Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPF18Q99633 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPF18Q99633 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPF18Q99633 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms