Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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