Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMA16Q96EY4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q96EY4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms