Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms