Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms