Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDI1Q8WTU0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDI1Q8WTU0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDI1Q8WTU0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDI1Q8WTU0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDI1Q8WTU0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDI1Q8WTU0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDI1Q8WTU0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDI1Q8WTU0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DDI1Q8WTU0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DDI1Q8WTU0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDI1Q8WTU0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms