Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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