Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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BEST4Q8NFU0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BEST4Q8NFU0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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