Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CSNK2A3Q8NEV1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CSNK2A3Q8NEV1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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