Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms