Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms