Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms