Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms