Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms